磷化氫為劇毒物質，它主要經呼吸道吸入體內。進入體內的磷化氫通過血液分布到全身各個器官和組織，而其中以肝、腎、脾中含量為最高。磷化氫在體內經代謝分解，最終以無機磷和磷酸鹽的形式經尿排出。少量磷化氫以原形經肺呼出。

磷化氫的毒作用主要是損害中樞神經系統以及肝、腎、心臟等實質臟器。它作用于細胞的呼吸酶，抑制細胞色素氧化的活性，使細胞發生內窒息，從而產生細胞代謝障礙。

磷化氫中毒的特征是它在不刺激呼吸道粘膜的情況下被吸入而直接導致急性中毒死亡。吸入磷化氫引起急性中毒，多在吸入后1～3小時發病，個別的在長達24小時之后才發病。中毒后的癥狀，輕時有難受、胸部感到受壓、胸骨內疼痛、咳嗽、眩暈、耳鳴、呼吸困難、頭部麻痹、后頭部劇痛、食欲不振、突然摔倒等，重時有四肢痙攣、步行困難、瞳孔擴大、肺及支氣管充血和出血、內臟器官的脂肪積聚、肺水腫等并可在24小時內死亡。

長期接觸低濃度磷化氫可出現頭暈、頭痛、失眠、無力、惡心、食欲不振、鼻干、嗅覺減退等癥狀。

吸人磷化氫的患者應迅速轉移至無污染區，安置休息并保持溫暖舒適。對呼吸微弱或停止者，應立即進行輸氧或人工呼吸，給強心劑，服用加糖的濃茶和咖啡。咳嗽可服可待因。

安全防護

工作時不能露出皮膚。通風以保持空氣新鮮干燥。氣體鋼瓶要存放在陰涼干燥通風良好之處，要遠離熱源和火種，最好戶外存放。設備管道可用氦探漏器、肥皂水探漏。應配備好應急處置用品。

純PH3對通用金屬材料無腐蝕性，但是在正常條件下不宜使用鋁、鋁合金和銅。可以使用碳鋼、不銹鋼、蒙乃爾、鎳基合金、聚四氟乙稀、聚三氟氯化乙烯聚合體、三氟氯乙烯樹脂、尼龍、氟化橡膠、玻璃、石英、硼硅酸玻璃。可能發生磷烷著火的部位盡量避免使用可燃性材料。

當磷化氫著火時，要考慮到其毒性很強，首先應考慮的是要全力以赴止住氣體的流出。滅火會產生爆炸性氣體，所以有時不一定好。當火勢很大，有可能危及周圍時，為了控制火勢和降低周圍溫度，用霧狀水噴射。可用的滅火劑為泡沫、一氧化碳和霧狀水。

從設備和管道中漏氣時，把浸了吸收劑的破布放在泄漏處，再蓋上草席、聚乙烯苫布等，然后在其上面再灑吸收劑。吸收劑主要由氯化亞鐵組成。

因為磷化氫毒性很強，所以廢氣一定要經過處理之后才能排放。對處理液或處理殘渣也要注意，避免第二次污染。廢氣可用水、高錳酸鉀溶液、高錳酸鉀和苛性堿混合溶液、氯化鐵溶液、次溴酸鈉溶液等來吸收或沖洗。可用活性碳等吸附劑吸附，或用臭氧氧化成低毒物或者在嚴格控制下燃燒后排放(參見附錄廢氣處理部分)。